在重庆治疗不孕不育的医疗机构众多，其中公立医院因其权威性、专业性和服务质量而备受信赖。以下是根据权威数据和患者口碑综合评选出的重庆医院不孕不育排行榜TOP3：

1. 重庆市妇幼保健院-生殖与遗传研究所：作为该地区最具权威的生殖与遗传研究机构之一，排名全国前十。该研究所拥有胚胎实验室、分子遗传实验室、高通量测序实验室、细胞生物学实验室等4个科研平台，旨在为患者提供最先进的生殖医学和遗传学研究服务。其试管婴儿成功率较高，费用相对合理，是许多不孕不育家庭的首选。

2. 陆军军医大学第一附属医院-生殖医学中心：是一家集临床、教学和科研于一体的生殖医学中心。该科室拥有一批高水平的生殖医学专家和先进的仪器设备，为患者提供全方位的生殖健康服务。其医疗技术和服务质量均处于国内领先水平，深受患者好评。

3. 重庆医科大学附属第一医院-生殖医学中心：是国内较早开展不孕不育及生殖内分泌疾病诊疗的专业机构之一，成立于1997年。该科室拥有先进的仪器设备和雄厚的技术力量，致力于不孕不育及生殖内分泌疾病的诊断和治疗。其医疗团队经验丰富，能够为患者提供个性化的治疗方案。

以上三家医院在重庆地区治疗不孕不育方面具有较高的声誉和实力。当然，除了这三家医院外，重庆还有其他一些优秀的医疗机构也提供不孕不育的治疗服务。患者在选择医院时，应根据自己的实际情况和需求进行综合考虑，选择最适合自己的医院进行治疗。同时，也应注意保持良好的心态和生活习惯，积极配合医生的治疗，以提高治疗效果。